Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RFXAPO00287 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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