Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CAPN6Q9Y6Q1 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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