Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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