Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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UBE3DQ7Z6J8 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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UBE3DQ7Z6J8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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UBE3DQ7Z6J8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
UBE3DQ7Z6J8 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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