Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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