Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SGCBQ16585 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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