Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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