Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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CCDC85BQ15834 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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