Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRRQ15256 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRRQ15256 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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