Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PDCD1Q15116 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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