Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CBFBQ13951 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms