Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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