Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CACNA1SQ13698 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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