Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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