Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPN13Q12923 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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