Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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HOXA13P31271 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HOXA13P31271 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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