Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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HOXA2O43364 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXA2O43364 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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