Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GDAP2Q9NXN4 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GDAP2Q9NXN4 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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