Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC9Q96Q05 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms