Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CCDC93Q567U6 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CCDC93Q567U6 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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