Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
NRF1Q16656 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NRF1Q16656 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms