Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC85BQ15834 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms