Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IHHQ14623 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IHHQ14623 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
IHHQ14623 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
IHHQ14623 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
IHHQ14623 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms