Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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