Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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SGCGQ13326 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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