Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NME3Q13232 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NME3Q13232 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms