Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SREBF2Q12772 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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