Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHRNEQ04844 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms