Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRGP23470 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRGP23470 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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