Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXA5P20719 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms