Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ANKRD28O15084 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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