Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP35Q9P2H5 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP35Q9P2H5 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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