Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPN18Q99952 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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