Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GRIK4Q16099 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
GRIK4Q16099 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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