Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SS18Q15532 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SS18Q15532 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms