Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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SEC23BQ15437 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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