Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CACNA1SQ13698 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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