Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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CDH18Q13634 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CDH18Q13634 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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