Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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