Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1BQ13112 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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