Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms