Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms