Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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HOXD12P35452 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD12P35452 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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