Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U3KQE9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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U3KQE9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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U3KQE9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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U3KQE9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
U3KQE9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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