Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA3Q9Y6H8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA3Q9Y6H8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms