Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
WASHC2CQ9Y4E1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WASHC2CQ9Y4E1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms