Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC5Q9UQL6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC5Q9UQL6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms