Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGTPBP1Q9UPW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1Q9UPW5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms