Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDHA12Q9UN75 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms