Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms